Le Dr Dean Hamer et ses chercheurs du National Cancer Institute affirment avoir découvert que « l’orientation sexuelle masculine est génétiquement influencée ». Initialement, ils ont découvert des taux élevés d’homosexualité maternelle, mais non paternelle, dans les familles de 76 gays. Cela suggère une transmission maternelle potentielle de l’homosexualité via le chromosome X. Ainsi, l’équipe a examiné 22 régions ou « loci » couvrant le chromosome X de 40 paires de frères homosexuels qui s’étaient portés volontaires pour être étudiés à travers des publicités dans des publications homosexuelles. Les chercheurs ont découvert que 33 des 40 paires de frères partageaient des marqueurs génétiques identiques dans cinq loci de la région Q28 du chromosome X. Cela les a amenés à conclure qu’un ou plusieurs gènes de cette région influencent l’expression de l’homosexualité chez au moins 64 pour cent des frères testés.‎

Les autorités scientifiques de la région ne sont pas convaincues qu’un lien ait été établi. Par exemple, Ruth Hubbard, professeur émérite de biologie à l’Université Harvest et co-auteur de Exploding the Gene Myth, a commenté : « Cette étude, comme des conclusions similaires précédentes, est erronée. Elle repose sur des hypothèses simplistes sur la sexualité et est entravée par la quasi-impossibilité d’établir des liens entre les gènes et le comportement. […] Sur le nombre relativement restreint de frères et sœurs interrogés dans l’enquête, près d’un quart n’avaient pas [le niveau approprié] marqueurs. De plus, les chercheurs n’ont pas procédé à l’expérience de contrôle évidente ni vérifié la présence de ces marqueurs parmi les frères hétérosexuels des hommes homosexuels qu’ils ont étudiés.‎

En outre, un éditorial du prestigieux British Medical Journal a commenté la recherche de Hamer comme suit :

« Les résultats du lien sont ambigus… Dans leur analyse originale, Hamer et al. ont placé le gène de l’homosexualité à huit centimorgans en aval du marqueur le plus télomérique. La courte distance physique entre ce marqueur et le télomère rend cependant ce résultat « discutable ».

L’éditorial concluait :

« L’affirmation d’un lien entre l’homosexualité masculine et le chromosome Xq28 a de vastes implications sociales et politiques. Pourtant, la question scientifique est complexe et l’interprétation des résultats est entravée par des incertitudes méthodologiques. Une étude plus approfondie est cruciale pour confirmer ou infirmer cette découverte. »

Enfin, le Dr Paul Cameron et ses collègues, après un examen attentif de cette étude et des consultations avec divers experts, ont également rejeté les conclusions de Hamer. Ils ont souligné : Une corrélation entre des marqueurs génétiques spécifiques n’implique pas qu’un ou plusieurs gènes aient causé l’homosexualité des frères. Les résultats pourraient indiquer un autre trait partagé par ces sujets et ‎disproportionnellement courant chez les gays, comme la promiscuité, l’exhibitionnisme ou d’autres caractéristiques de personnalité connues pour être associées à l’homosexualité masculine.